某社長ブログ

GRヤリスのGRガレージでのECUアップグレードに関してJAFからの正式な回答が質問者に対してありました。
回答は下記の通りでPN車両でのアップグレードは「不可」との判断です。
PN車両としてJAF公認競技会に参加する選手は留意してください。（既に施工した車は残念ながら元に戻す必要があります。）

以下、JAFからの回答文
「自動車製造者による当該ECUの変更サービス（GR UPGRADE SELECTIONS）を実施し、設定変更を行うことは改造に該当いたします。また、国内競技車両規則第3編第3章スピードPN車両規定　第2条に基づき、第１章および第3章スピードPN車両規定に規定される以外の改造は認められません。従いまして、第3章スピードPN車両規定において電子制御装置（ECU）の改造は規定されておりませんので、当該ECUの変更サービスの実施は認められません。」

「GR UPGRADE SELECTIONS」
https://toyotagazooracing.com/jp/gr/yaris/upgrade-selections/